Né en 1958, François Baatard est marié et père de deux enfants adultes. Il a fait ses écoles et ses études à Lausanne: une licence et un diplôme de spécialisation à la Faculté de Théologie de Lausanne.
François Baatard a été l'assistant du prof. R. Campiche (sociologie de la religion), puis du prof. C. Bridel (Institut Romand de Pastorale). Il a fait son stage pastoral dans la paroisse de Morrens-Montheron, puis a été en ministère pastoral dans la paroisse de Noville (1988-2003).
Actuellement, il est pasteur dans la paroisse de La Sallaz-Les Croisettes à Epalinges.